Es la capital y el punto de partida para los viajes a los Ríos Tambopata, Piedras y bajo Madre de Dios. Hay vuelos diarios de Lima o Cusco.
Para el viajero más aventurero, hay un camino de tierra desde Cusco que toma un mínimo de tres días por camión con las incomodidades predecibles y retrasos. La capital de la región es Puerto Maldonado, un pueblo aún pequeño fundado en 1912.
Es el pueblo más importante de la selva sur. Se localiza a 210 msnm en la unión de los Ríos Tambopata y Madre de Dios. El Río permite el acceso a ciudad de Ribera Alta en Bolivia (5 horas) y por tierra en minibús o automóvil a Assis en Brasil (242 km). A pesar de su historia comercial, Puerto Maldonado ha crecido despacio. Sin embargo desde el año 2000 mantiene la tasa de crecimiento poblacional más alta del país.
 La temporada alta turística en Puerto Maldonado es de mayo a noviembre. Muchas personas jóvenes caminan al rededor de la plaza de Armas, calles cercanas y restaurantes como: la pizzería, heladería, comercio en general, y hasta discotecas. Todo ello brinda una excelente oportunidad para hacer una escala agradable antes y después de las visitas a la profundidad de la selva.
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